利用甲醇期货基差进行套利操作有两种操作：利用基差进行正向套利操作和利用基差进行反向套利操作。具体如下：

1、利用基差进行正向套利操作：当甲醇期货价格高出现货价格时，投资者可在买入现货甲醇的同时卖出等量的甲醇期货，建立套利头寸，买入基差，等待期现价差收敛时平掉套利头寸或通过交割结束套利；

2、利用基差进行反向套利操作：当现货甲醇价格被高估而某个交割月份的期货合约被低估时，投资者可买入甲醇期货的同时卖空现货，建立反向套利头寸，当现货和期货价格趋于正常区间时范围，同时平仓，获利了结。

注意，在进行基差套利时，投资者需要考虑仓储成本、融资成本、交割规则、税费等因素，以及个人或机构的交易能力和风险承受能力。